За периода от своето създаване Лабораторията е взела участие в повече от 60 научно-изследователски и научно-приложни проекти, включително 15 международни проекта в рамковите програми на Европейската Комисия.

Публичните международни и национални проекти са свързани с:

• генериране на алгоритми за контролни суми, използвани в модулите, гарантиращи сигурността на данните;
• анализ и оценка на компютърна сигурност в мрежова среда;
• създаване на процедури за проверка на комуникационна сигурност на корпоративно комуникационно оборудване;
• експериментални изследвания на сигурността на система за нестандартни системни конфигурации на корпоративни организации;
• цялостно апробиране на програмни и апаратни средства, използвани за покриване на международни стандарти в областта на информационна сигурност;
• поръчкови изследвания за анализ и оценка на сигурността на крайно високочестотно безжично оборудване;
• изследвания, свързани с проверка на пълен жизнен цикъл и пълна мощност на криптопроцедури, използвани за оценка на криптографична сигурност на корпоративни програмни средства;
• експериментални изследвания, свързани с правилата за обработка на графични и музикални обекти и съответната им оценка по отношение на стеганосигурност;
• анализ и оценка на Интернет/Екстранет/Интранет критични инфраструктурни обекти по отношения на тяхната кумулативна киберсигурност.

Проекти, изпълнявани за Министерство на отбраната:

• антивирусна оценка на компютърни и комуникационни взаимодействия;
• възможности за използване на антивирусна защита в локални операции;
• планиране на оперативни действия в мрежова операционна система;
• антивирусна защита на офис-работни места в мрежова среда;
• антиспам процедури за защита и профилактика на сървъри;
• динамично управление на резидентни защити в мрежова среда;
• оценка на заплахите в SQL базирани приложения и системи;
• възможности за анализ на системни регистри в реално време;
• процедури за сигурност в системи с firmware компоненти.
• методи и средства за защита от мрежови rootkit атаки.

Проекти, изпълнявани за Министерство на вътрешните работи:

• изграждане на сървърни защити в реално време за бази от данни;
• оценка на възможностите за проникване в защитени мрежи;
• вирусни сигнатури с двойно действие и тяхното използване;
• технически средства за защита от мрежови въздействия;
• анализ на злонамерени атаки в WEB-базирани приложения;
• процедури и политики за сигурност в йерархични мрежови структури;
• изграждане и управление на spam филтри за локални мрежи;
• възможности за защита от spyware при безжични приложения;
• динамично управление на бази данни от вирусни сигнатури;
• защита от прониквания в корпоративни мрежови структури.

Проекти, изпълнявани за Министерството на образованието и науката:

• компютърно моделиране на вируси и тяхното разпространение;
• оценка и анализ на злонамерени атаки и злонамерен софтуер;
• национален портал за киберсигурност.